小非编码RNA (Small noncoding RNA, sncRNA)是生命活动的重要调控因子，在基因表达调控、生物发育、代谢和疾病中发挥着重要作用。然而，目前许多现有检测方法对＜22个核苷酸(nt)的超短sncRNA的检测特异性较差。CRISPR/Cas13a系统是一种很有前景的核酸检测技术，可在不受基因组DNA干扰的情况下直接检测sncRNA。目前的报告表明，标准CRISPR/Cas13a系统检测28 nt 靶标RNA时可在20分钟内迅速产生强烈的荧光信号，然而检测超短靶标RNA时的检测性能急剧下降。

针对这一挑战，深圳大学化学与环境工程学院刘翼振副教授在国际分析化学顶级期刊、自然指数收录期刊《Analytical Chemistry》上发表了题为“Foldback-crRNA-Enhanced CRISPR/Cas13a System (FCECas13a) Enables Direct Detection of Ultrashort sncRNA”的研究成果。深圳大学为独立通讯单位，已申请国家发明专利（CN116287129A）。 https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02687

回折crRNA增强的CRISPR/Cas13a系统检测超短sncRNA

如图所示，该研究提出了一种回折crRNA增强的CRISPR/Cas13a (FCECas13a)系统，解决了现有CRISPR/Cas13a系统在检测超短sncRNA方面的局限性。对于17 nt的超短RNA, FCECas13a系统表现出了与标准的28 nt靶RNA系统相当的优秀反式切割性能。本研究将这种方法用于miRNA720（17 nt）和miRNA2392（20 nt）短链的测试，证实了其不仅能检测传统CRISPR/Cas13a无法检测的超短链，而且达到了fM级的灵敏度。本研究提出的FCECas13a系统克服了长期以来直接检测超短RNA的挑战。FCECas13a系统的简单、敏感和特异性，加上其与其他检测方法的兼容性，使其成为各种临床诊断和商业应用的有力工具。

      感谢广东省自然科学基金、深圳市高校稳定支持计划面上项目的大力支持！