本中心由深圳大学和清华大学的优势团队联合建设，是深圳大学化学与环境工程学院下设相对独立的科研机构，并与深圳水务局建立长期战略合作关系。中心针对华南地区滨海城市特征，以水利科学与工程和环境工程的综合学科交叉及创新研究为目标，开展城市水文学、环境生态学、环境化学、水资源规划与管理、水环境修复等领域的基础前沿研究，以及河道生态环境修复、智慧水务、水污染治理等方面的技术开发和应用。根据发展需要，以中心为依托，从事成果推广、转化以及与产业化有关的工作。本中心主任由中国科学院院士王光谦教授担任。